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마크로젠은 2001년 한국인 게놈 지도 BAC Clone Library 구축하였습니다. 총 10만여 개의 BAC clone |
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을 만들었으며, 모든 BAC clone들의 insertion part를 end-sequencing 하였습니다. 그 후 bioinformatics |
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tool을 이용, 10만 개의 BAC clone의 순서와 위치를 확정하여 최종적으로 library를 완성하였습니다. |
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한국인 게놈 library를 바탕으로 마크로젠은 array CGH chip을 제작하였습니다. 이를 위해서 10만 개 |
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의 BAC clone 중에서 4,500여 개의 BAC clone을 선정하였습니다. Genome variation이 빈번히 보고 |
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된 부분을 위주로 하고 각 probe 사이의 간격을 고려하여 1차로 probe 후보군을 정한 다음, 모든 후 |
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보 Clone들을 FISH(Fluorescence In Situ Hybridization) probe실험으로 실제 검증하였습니다. |
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Microarray 분석결과 유효한 변화가 있는 것으로 판단된 각 clone의 FISH를 통하여 |
| | Sample의 metaphase 혹은 interphase에서 재확인이 가능합니다. |
| | 또한 이외에 기타 주문 제작 서비스도 가능합니다. 자세한 사항은 별도문의 바랍니다 |
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| 실험 방법은 위와 같습니다. 서로 다른 색의 dye로 staining된 test sample과 reference sample을 각각 같은 양으로 hybridization시킵니다.(Competitive hybridization) 대부분의 chromosome은 test와 reference sample에서 같은 copy number를 갖기 때문에 log ratio plot에서 0에 위치합니다. 반면 test sample에서 copy number(ex: duplication)가 증가했거나 감소(ex: deletion)했다면 그림에서와 같이 다른 수치를 보여줍니다. |
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Array comparative genomic hybridization analysis of uterine leiomyosarcoma.
Gynecologic Oncology. 2005 Dec;99(3):545-51. Epub 2005 Aug 24.
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Genomic alterations identified by array comparative genomic hybridization as prognostic markers in tamoxifen-treated estrogen receptor-positive breast cancer. BMC Cancer. 2006 Apr 12;6:92
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The genetic differences between gallbladder and bile duct cancer cell lines.
Oncology Reports. 2006(16):949-56
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| Y chromosome loss and other genomic alterations in hepatocellular carcinoma cell lines. Cancer Genetics and Cytogenetics. 2006 Apr 1; 166(1):56-64ii
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