실험완료 후 얻은 chip image data를 이용하여, filtering, normalization의 과정을 거쳐, 통계적으로
차별 발현하는 유전자를 선별하고, 기능별로 분류 분석합니다.
분석항목은 아래와 같으며, 고객 요구에 따른 맞춤형 서비스가 마련되어 있습니다.
자세한 분석관련 상담은 담당자에게 연락 바랍니다.
|
| Task |
Detail |
| Data Output |
Raw data files(Experimental data processing) |
| Control summary plot |
| Annotation information |
| Pre-processing service |
Data quality chceck
(scatter plot, summary statistics table,box plot,correlation table) |
| Normalization(Global,Quantile normalization,etc.) |
| Filtering(filtering data based on quality assessment) |
| Data Transform |
| Statistical test |
Fold change |
Identying differentially expressed genes :
Using t-test, LPE test, ANOVA, etc. |
Multiple Testing :
pvalue correction (FDR, Bonferroni, etc.) |
| Clustering |
Hierarchical and K-means;
together genes with similar profiles and discovers gene relationships |
| Functional analysis |
Classifcation the content of DEG in terms of Panther database |
| Pathway Analysis(KEGG Database) |
| Visualization |
Venn-diagram, Heat Map, etc. |
| Summarize Results & Report |
Write the Final Result Report |
|
|
| |
|
